甘肃中医学院临床医学院设有临床医学五年制本科、临床医学免费定向五年制本科及临床医学专科起点二年制本科三个专业（方向）。临床医学院设有办公室、团总支以及诊断学、内科学、外科学三个教研室；在五所附属医院设有25个教研室，共有专兼职教师134名，其中教授26名，副教授57名，讲师51名。现有管理人员10名，临床医学院院长刘丽、党总支书记齐彤、副院长张华。截至2014年3月，临床医学院学生共计1640人。临床医学专业自2002年起开始招收五年制本科，2006年开始招收临床医学专科起点本科，2010年开始招收临床医学免费定向本科。
近年来，我院办学实力、办学水平不断提升，社会影响不断扩大，生源质量逐年提高，招生分数呈现逐年上升态势，2011年临床医学专业最低录取分为480分，高于分数线32分；2012年最低录取分为500分，高于分数线38分，2013年最低录取分为481，高于分数线51分。
专业建立十余年来，以甘肃省人民医院、附属兰州市第一人民医院、附属兰州石化总医院、附属酒泉市人民医院、附属天水市第一人民医院五所三级甲等医院为依托，采取基础课与专业课分段式教学的方式不断提高教学质量，在各个专业的学生培养中，已经形成了理论教学扎实，实践教学突出的鲜明特色。2013年3月，临床医学院组队参加了在西安交通大学第一附属医院举行的第四届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛西南西北分区赛，获得三等奖的好成绩。
我院在培养学生专业技能的同时，注重学生综合能力的提升，临床医学院以团总支、团支部为主体，以“大学生社团文化艺术节”和“大学生学术科技创新博览节”等活动为载体，开展了丰富多彩的校园学术、科技、文化及体育活动。学生通过活动，陶冶了情操，强健了体魄，培养了创新精神，提高了实践能力，实现了第二课堂对第一课堂的有效补充和积极促进，学生综合能力大幅提高，毕业生就业率连续5年达到100%，就业层次稳步提高，实现了培养应用型人才，服务甘肃地方医药卫生事业的发展的培养目标。2014年临床医学专业本科毕业生共235人，专升本毕业生38人。
临床医学院在本科教育快速发展的同时，研究生教育也取得了突破性进展，2011年获得临床医学一级学科硕士授权点，授权点涵盖了内科学、外科学、妇产科学、儿科学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、护理学、老年医学、神经病学、精神病与精神卫生学、皮肤病与性病学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、康复医学与理疗学、运动医学、麻醉学、急诊医学等18个二级学科，同时与甘肃省人民医院、兰州军区总医院等多家医院共同合作，建立了稳定的研究生培养基地。2012年起，临床医学院招收硕士研究生23名，2013年招收29人。
甘肃中医学院临床医学院将继承和发扬甘肃中医学院的优良传统和办学精神，秉承“仁术勤和，玉汝于成”的育人理念,坚持“勤奋、严谨、继承、创新”的校风学风，不断优化、整合学校和各附属医院优势与力量，培养符合社会发展的应用型医学人才。
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